Her sezon ayrıca ulusal kupa da düzenlenir. Bu kupada, aynı kademedeki tüm takımlar eleme sistemiyle oynanan bir kupada birbirleriyle karşılaşır. (Ülke başına bir kupa)
1-6. kademelerdeki kulüpler tek bir kupada birlikte mücadele eder. Ulusal kupa genel görünümünü açmak için resmi maç menüsüne git ve kupa sekmesini seç.
1-6. kademelerdeki kupaya en fazla 16380 takım katılır ve toplam 14 maç günü oynanır.
7. ve daha alt kademelerde ayrı kupa organizasyonları bulunur.
Genellikle haftada bir kupa maçı oynanır; iki haftada ise ikişer maç yapılır.
İlk kupa turunda her zaman otomatik olarak tur atlayan birkaç takım vardır. Bu takımlar otomatik olarak ikinci tura yükselir.
Ulusal kupada çok ilerlemenin birçok faydası vardır. Tüm bilet geliri takımlar arasında paylaştırılır, bu nedenle önemli kazançlar elde edebilirsin. Oyuncuların ayrıca maç başına 0,6 deneyim puanı kazanır; bu, normal bir lig maçındakinin 1,5 katıdır.
İlerleyerek Başarılar da kazanabilirsin.
Oyuncun kupada en çok golü atmayı başarırsa gol kralı ödülünü de kazanabilirsin.
Gol kralı listesini görmek için Ulusal kupa ekranının sol tarafındaki bombardıman simgeli düğmeye tıkla.
Kupa Finali'nde seyirci geliri yoktur. Bunun yerine, Kupa galibi 7.000.000€ ödülünü alırken, kaybeden finalist 3.000.000€ alır.
Kupa Finali maçı tarafsız sahada oynanır; bu nedenle özel dekorasyon binalarından (Moai binaları gibi) gelen iç saha ve deplasman bonusları hesaba katılmaz.
Ulusal kupa maçları rastgele belirlenerek iç sahada veya deplasmanda oynanır (tarafsız sahada oynanan Final hariç).